{"id":399,"date":"2016-06-17T09:40:00","date_gmt":"2016-06-17T09:40:00","guid":{"rendered":"http:\/\/www.fizyka.umk.pl\/~erihs\/?page_id=399"},"modified":"2026-02-21T12:36:46","modified_gmt":"2026-02-21T12:36:46","slug":"identyfikacja-zagrozenia-mikrobiologicznego","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/www.e-rihs.pl\/index.php\/identyfikacja-zagrozenia-mikrobiologicznego\/","title":{"rendered":"Identyfikacja zagro\u017cenia mikrobiologicznego"},"content":{"rendered":"<h1><span style=\"color: #000000;\"><strong>\u00a0&#8211; analiza r\u00f3\u017cnorodno\u015bci mikroorganizm\u00f3w na powierzchni obiekt\u00f3w dziedzictwa kulturowego oraz w \u015brodowisku ich przechowywania<\/strong><\/span><\/h1>\n<p><strong>Dysponent<\/strong>: Uniwersytet Ekonomiczny w Krakowie<\/p>\n<p><strong>Kontakt:<\/strong>\u00a0<a href=\"mailto:sawoszct@uek.krakow.pl\">dr hab. Tomasz Sawoszczuk, prof. UEK\u00a0<img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" src=\"https:\/\/fizyka.umk.pl\/~erihs\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/koperta.gif\" alt=\"koperta\" width=\"14\" height=\"16\" \/><\/a><\/p>\n<h2><strong>Opis metody<\/strong><\/h2>\n<p style=\"text-align: justify;\">Metoda PCR-DGGE (ang. polymerase chain reaction \u2013 denaturing gradient gel electrophoresis) &#8211; czyli reakcja \u0142a\u0144cuchowa polimerazy w po\u0142\u0105czeniu z elektroforez\u0105 w gradiencie czynnika denaturuj\u0105cego. Umo\u017cliwia ona pozyskanie informacji o strukturze genotypowej mikroorganizm\u00f3w obecnych w badanym \u015brodowisku na podstawie analizy r\u00f3\u017cnic w wybranych sekwencjach genomu. Umo\u017cliwia ona tak\u017ce, identyfikacj\u0119 takson\u00f3w obecnych w \u015brodowisku oraz \u015bledzenie zmian bior\u00f3\u017cnorodno\u015bci w czasie. Najwi\u0119ksz\u0105 zalet\u0105 metody PCR-DGGE jest mo\u017cliwo\u015b\u0107 pomini\u0119cia etapu hodowli w badaniach mikrobiologicznych, co jest niezwykle wa\u017cne, gdy\u017c zaledwie niewielki procent mikroorganizm\u00f3w mo\u017cna wyhodowa\u0107 w warunkach laboratoryjnych.<\/p>\n<h2 style=\"text-align: justify;\"><strong>Zastosowanie<\/strong><\/h2>\n<p style=\"text-align: justify;\">W dziedzinie badania obiekt\u00f3w zabytkowych metoda znajduje zastosowanie przede wszystkim do:<\/p>\n<ul style=\"text-align: justify;\">\n<li>identyfikacji zagro\u017cenia mikrobiologicznego obiekt\u00f3w dziedzictwa kulturowego,<\/li>\n<li>badanie poziomu ska\u017cenia mikrobiologicznego obiekt\u00f3w i \u015brodowiska,<\/li>\n<li>identyfikacji mikroorganizm\u00f3w w celu wykrycia grzyb\u00f3w i bakterii posiadaj\u0105cych potencja\u0142 niszcz\u0105cy,<\/li>\n<li>monitorowanie czysto\u015bci mikrobiologicznej powietrza wewn\u0119trznego pomieszcze\u0144 przechowywania obiekt\u00f3w<\/li>\n<\/ul>\n<h2 style=\"text-align: justify;\"><strong>Aparatura<\/strong><\/h2>\n<p style=\"text-align: justify;\">W badaniach wykorzystywane s\u0105:<\/p>\n<ul style=\"text-align: justify;\">\n<li>termocykler T100 BioRad,<\/li>\n<li>zestaw do elektroforezy poziomej Polygen,<\/li>\n<li>zestaw do DGGE &#8211; DCode Universal Mutation Detection System BioRad,<\/li>\n<li>pr\u00f3bnik powietrza Mas-100 Eco Merck.<\/li>\n<\/ul>\n<h2 style=\"text-align: justify;\"><strong>Warunki pomiaru<\/strong><\/h2>\n<p style=\"text-align: justify;\">W przypadku badania obiekt\u00f3w pr\u00f3bki pobiera si\u0119 w miejscu ich przechowywania,\u00a0 stosuj\u0105c sterylne wymaz\u00f3wki &#8211; pob\u00f3r kontaktowy, nie niszcz\u0105cy. W przypadku analizy \u015brodowisk, pr\u00f3bki powietrza pobiera si\u0119 pr\u00f3bnikiem Mas-100 Eco w badanym pomieszczeniu.<\/p>\n<h2 style=\"text-align: justify;\"><strong>Format wynik\u00f3w<\/strong><\/h2>\n<p style=\"text-align: justify;\">Przedstawiona procedura badawcza umo\u017cliwia przeprowadzenie analizy ilo\u015bciowej genotyp\u00f3w obecnych w badanym \u015brodowisku, a tak\u017ce ocen\u0119 jako\u015bciow\u0105 dominuj\u0105cych takson\u00f3w mikroorganizm\u00f3w.<\/p>\n<table border=\"0\">\n<tbody>\n<tr>\n<td valign=\"&quot;top\">\n<p><div id=\"attachment_404\" style=\"width: 310px\" class=\"wp-caption alignnone\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" aria-describedby=\"caption-attachment-404\" class=\" wp-image-404\" src=\"https:\/\/fizyka.umk.pl\/~erihs\/nowaStrona\/wp-content\/uploads\/2016\/06\/UEK-Zagrozenie_Rys-1.png\" alt=\"Rys. 1. Przyk\u0142adowy fingerprint otrzymany dla pr\u00f3bek powietrza (Lech et al. 2015)\" width=\"300\" height=\"438\" \/><p id=\"caption-attachment-404\" class=\"wp-caption-text\">Rys. 1. Przyk\u0142adowy fingerprint otrzymany dla pr\u00f3bek powietrza (Lech et al. 2015).<\/p><\/div><\/td>\n<td valign=\"&quot;top\">\n<p><div id=\"attachment_403\" style=\"width: 218px\" class=\"wp-caption alignnone\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" aria-describedby=\"caption-attachment-403\" class=\" wp-image-403\" src=\"https:\/\/fizyka.umk.pl\/~erihs\/nowaStrona\/wp-content\/uploads\/2016\/06\/UEK-Zagrozenie_Rys-2.png\" alt=\"Rys. 2. Przyk\u0142adowy fingerprint dla powierzchni dokumentu pergaminowego (Lech, 2016).\" width=\"208\" height=\"602\" \/><p id=\"caption-attachment-403\" class=\"wp-caption-text\">Rys. 2. Przyk\u0142adowy fingerprint dla powierzchni dokumentu pergaminowego (Lech, 2016).<\/p><\/div><\/td>\n<\/tr>\n<\/tbody>\n<\/table>\n<h2><strong>Bibliografia <\/strong><\/h2>\n<p>Lech Tomasz, 2016, Evaluation of a Parchment Document, the 13th Century Incorporation Charter for the City of Krakow, Poland, for Microbial Hazards,<em> Applied and Environmental microbiology<\/em> <strong>82<\/strong>:9, <a href=\"http:\/\/aem.asm.org\/content\/early\/2016\/02\/15\/AEM.03851-15\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">doi:10.1128\/AEM.03851-15<\/a>.<\/p>\n<p>Lech Tomasz, Ziembinska-Buczynska Aleksandra, 2015, Evaluation of a Modified Sampling Method for Molecular Analysis of Air Microflora, <a href=\"http:\/\/europepmc.org\/abstract\/med\/25966086?europe_pmc_extredirect=http:\/\/dx.doi.org\/10.4238\/2015.April.10.32\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"><em>Genetics and Molecular Research,<\/em> 14 (2), 3200-3208.<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>\u00a0&#8211; analiza r\u00f3\u017cnorodno\u015bci mikroorganizm\u00f3w na powierzchni obiekt\u00f3w dziedzictwa kulturowego oraz w \u015brodowisku ich przechowywania Dysponent: Uniwersytet Ekonomiczny w Krakowie Kontakt:\u00a0dr hab. Tomasz Sawoszczuk, prof. UEK\u00a0 Opis metody Metoda PCR-DGGE (ang. polymerase chain reaction \u2013 denaturing gradient gel electrophoresis) &#8211; czyli &hellip; <a href=\"https:\/\/www.e-rihs.pl\/index.php\/identyfikacja-zagrozenia-mikrobiologicznego\/\">Czytaj dalej <span class=\"meta-nav\">&rarr;<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"footnotes":""},"class_list":["post-399","page","type-page","status-publish","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.e-rihs.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/399","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.e-rihs.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.e-rihs.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.e-rihs.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.e-rihs.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=399"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/www.e-rihs.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/399\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":3376,"href":"https:\/\/www.e-rihs.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/399\/revisions\/3376"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.e-rihs.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=399"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}